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Glenresearch BACKBONE MODIFICATION

　更新时间：2018-08-15　点击量：2151

美国GRC公司：Glen Research Corp 创建于1987年，专注于为DNA和RNA寡核苷酸的化学合成，修饰，标记和纯化提供zui广泛的亚磷酰胺和固体支持物，现已有近三十年的历史，在低聚核苷酸及修饰、改性领域一直处于地位。

Glenresearch BACKBONE MODIFICATION

骨干修改

甲基膦酰胺

甲基膦酰胺可以按照常规的CE亚磷酰胺方案用于DNA合成仪中，以产生含有一个或多个甲基膦酸酯键的寡核苷酸。但是，脱保护和纯化技术不同，程序说明包含在技术公告中。我们还提供具有乙酰基保护的dC单体。¹ 在裂解步骤中用氢氧化铵除去该保护基团，在脱保护步骤中使用乙二胺中的乙二胺消除dC位点的修饰。

项目	目录号	包	价格（$）

dA-Me膦酰胺	10-1100-02	0.25克	90.00
	10-1100-05	0.5克	180.00

Ac-dC-Me膦酰胺	10-1115-02	0.25克	90.00
	10-1115-05	0.5克	180.00

dG-Me膦酰胺	10-1120-02	0.25克	90.00
	10-1120-05	0.5克	180.00

dT-Me膦酰胺	10-1130-02	0.25克	90.00
	10-1130-05	0.5克	180.00

参考

MP Reddy，F。Farooqui和NB Hanna，Tetrahedron Lett。，1996,37,8691-8694。

其他仪器类型

所有次要碱基，RNA产物和改性剂都包装在适用于ABI和其他仪器的隔膜小瓶中。如果您想要其他类型的样品瓶/色谱柱，请将以下内容添加到目录号的末尾。

单体
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Mermade	中号
列
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Applied Biosystems 3900	一个
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PACE亚磷酰胺

膦酰基乙酸酯（PACE）修饰的寡核苷酸作为生物修饰剂在各种研究应用中显示出巨大的潜力。PACE单体是膦酰基羧酸酯单体家族的一部分。单体可以容易地掺入复杂的寡核苷酸中，并且与多种其他糖或异碱基修饰相容。PACE DNA可以通过羧酸官能团缀合。已显示它们在siRNA双链体中具有活性，并且当与硫代磷酸酯结合时加速RNase H-1的初始切割速率。然而，迄今为止有趣的观察结果是它们在培养细胞的渗透方面表现出的增强。

膦酰基乙酸盐*溶于乙腈，推荐浓度为0.1M，与标准DNA合成仪兼容。使用标准方案时，建议使用1H-四唑的33.3分钟偶联时间。我们上提供了一种改进的用于AB仪器的LV循环，可将1H-Tetrazole的偶联时间缩短至15分钟。氧化必须先于合成循环中的封端。氧化试剂取决于合成的类型。对于*修饰的寡核苷酸，我们推荐使用非水氧化剂樟脑磺酰氯氮杂环丙烷（CSO）作为0.1M溶液。对于混合磷酸二酯和膦酰基乙酸酯修饰的寡核苷酸，推荐使用0.5M CSO溶液。低水氧化剂，40-4032，虽然据报道这可以导致少量膦酰基乙酸酯转化为磷酸二酯，但它是另一种氧化剂。我们还建议使用Cap Mix B和DMAP（40-4020）代替含有1-甲基咪唑的标准Cap Mix B.

用于切割和去保护的标准方案需要两步法，使用1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一碳-7-烯（DBU）进行预处理，随后使用甲胺进行切割。DBU用于使二甲基氰基乙基（DMCE）保护基脱保护并在脱保护过程中防止碱的烷基化。建议在水中用40％甲胺裂解，并且当使用AMA脱保护时我们也有良好的结果。

项目	目录号	包	价格（$）

dA-PACE亚磷酰胺	10-1140-02	0.25克	100.00
	10-1140-05	0.5克	200.00
	10-1140-10	1.0克	400.00

Ac-dC-PACE亚磷酰胺	10-1150-02	0.25克	100.00
	10-1150-05	0.5克	200.00
	10-1150-10	1.0克	400.00

dG-PACE亚磷酰胺	10-1160-02	0.25克	100.00
	10-1160-05	0.5克	200.00
	10-1160-10	1.0克	400.00

dT-PACE亚磷酰胺	10-1170-02	0.25克	100.00
	10-1170-05	0.5克	200.00
	10-1170-10	1.0克	400.00

在乙腈中0.10M CSO	40-4631-52	200毫升	85.00
	40-4631-52E	200毫升	85.00

知识产权

这些产品受美国6,693,187和7,067,641，正在申请和Lievre Cornu拥有的外国同行的保护。购买所有或任何这些产品包括仅在仅用于研究的寡核苷酸的制造中使用该产品的有限许可，并且其使用未被授权也不用于诊断或治疗用途。

其他仪器类型

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列
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甲基亚磷酰胺

多年来，Glen Research除了β-氰乙基（CE）亚磷酰胺之外还提供了甲基亚磷酰胺，因为在这种情况下，不太活泼的氰乙基不是优势。我们的一些客户，可能记得用甲苯酚专门去除甲基，试图使用这些单体来制备有趣的，不带电的和核酸酶抗性的甲基磷酸三酯键。不幸的是，这种连接对氢氧化铵是不稳定的，并且形成了规则的磷酸二酯键（以及少量的断链）。我们为此应用提供UltraMild甲基亚磷酰胺。由这些单体制备的寡聚物可以用碳酸钾在甲醇中脱保护，以产生甲基磷酸三酯键。由于这些联系是非对映的和不带电荷的，寡头可能很难处理。因此，使用这些单体以及常规的UltraMild CE亚磷酰胺可能会产生嵌合体。如果寡核苷酸中包含许多dG残基，我们建议使用苯氧乙酸酐（Pac₂ O）在Cap A.此修改消除了异丙基苯氧基（IPR-PAC）保护基的dG的用乙酸从乙酸酐封端混合物的交换的可能性。

项目	目录号	包	价格（$）

Pac-dA-Me亚磷酰胺	10-1301-02	0.25克	25.00
	10-1301-05	0.5克	50.00
	10-1301-10	1.0克	100.00

Ac-dC-Me亚磷酰胺	10-1315-02	0.25克	25.00
	10-1315-05	0.5克	50.00
	10-1315-10	1.0克	100.00

iPr-Pac-dG-Me亚磷酰胺	10-1321-02	0.25克	25.00
	10-1321-05	0.5克	50.00
	10-1321-10	1.0克	100.00

dT-Me亚磷酰胺	10-1330-02	0.25克	25.00
	10-1330-05	0.5克	50.00
	10-1330-10	1.0克	100.00

其他仪器类型

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ULTRAMILD SOLVENTS / REAGENTS

项目	目录号	包	价格（$）
Cap Mix A
在THF /吡啶中的5％苯氧基乙酸酐	40-4210-52	200毫升	140.00
（Applied Biosystems）	40-4210-57	450ML	300.00

在THF中的5％苯氧基乙酸酐	40-4212-52	200毫升	140.00
机（Expedite）	40-4212-57	450ML	300.00

脱保护解决方案
0.05M甲醇中的碳酸钾	60-4600-30	30毫升	30.00

H-膦酸酯单体

通过HPLC分析Glen Research H-膦酸酯并进行合成测试。H-膦酸盐尤其可用于制备通过亚磷酰胺化学无法获得的修饰的核苷酸间键。常用的应用是放射性标记的硫代磷酸酯的制备，因为硫化反应在合成器外进行。这些单体包装在ABI型小瓶中（见注释框）。

项目	目录号	包	价格（$）

dA-H-膦酸盐，TEA盐	10-1200-02	0.25克	40.00
	10-1200-05	0.5克	80.00

dC-H-膦酸盐，DBU盐	10-1210-02	0.25克	40.00
	10-1210-05	0.5克	80.00

dG-H-膦酸盐，TEA盐	10-1220-02	0.25克	40.00
	10-1220-05	0.5克	80.00

dT-H-膦酸盐，TEA盐	10-1230-02	0.25克	40.00
	10-1230-05	0.5克	80.00

其他仪器类型

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H-膦酸盐试剂

我们的H-膦酸盐溶剂和试剂已经停产。使用高纯度产品和下面所示的配方可以容易地制备H-膦酸盐试剂。

1-金刚烷碳酰lu可购自Aldrich，目录号117722.稀释至0.1M。
（单体和封端剂的活化剂）

乙腈/吡啶（50:50），无水
（单体稀释剂）

乙腈/吡啶（95：5），无水
（活化剂稀释剂）

1％乙腈/吡啶中的异丙基亚磷酸酯（50:50）
（封端试剂）

乙腈/吡啶（50:50）
（中和剂和洗涤溶剂）

4％I ₂的吡啶/ H 2 O / THF（10:10:80）THF / H 2 O / TEA（80:10:10）
（两种试剂都是H-膦酸酯键氧化所必需的）

缩写

Ac ₂ O =乙酸酐
CE =氰乙基
CPG =受控孔径玻璃
DCA =二氯yi酸
DCM =二氯甲烷
DMAP =二甲基氨基吡啶
dmf =二甲基甲脒
DMT = 4,4'-二甲氧基三苯甲基
I ₂ =碘
iPr =异丙基
MeIm = 1-甲基咪唑
μm=微摩尔（s）
nm =纳摩尔（s）
Pac =苯氧基
乙酰基PhOAc =苯氧基乙酰基
TCA =三氯yi酸
THF =四氢呋喃

THIOPHOSPHORAMIDITES

在DNA磷酸二酯键中用硫原子取代两个非桥接氧原子产生二硫代磷酸酯（PS2）键。¹与天然DNA一样，二硫代磷酸酯键在磷上是非手性的。该类似物*抵抗核酸酶降解，并与DNA和RNA形成复合物，稳定性稍差。²此外，已发现PS2-ODNs与其磷酸二酯类似物^2-6结合的蛋白质具有更高的亲和力，这表明PS2-ODNs可能具有硫修饰的磷酸酯适体（硫代适体）^3,6-形式的额外效用。⁸用于治疗和诊断应用。

硫代亚磷酰胺（ThioPAs）不溶于无水乙腈稀释剂。相反，乙腈中的10％DCM（v / v）是所有四种硫代PA的理想稀释剂，终的亚胺浓度为0.15M。
在含有10％DCM的无水乙腈中，ThioPPA比正常DNA亚磷酰胺的稳定性稍差; 然而，在室温下溶解两天后，所有四种硫代PA的偶联效率都没有降低。
合成后，合成器上的thioPA瓶应更换为含有乙腈稀释剂的瓶子，合成器管线用乙腈冲洗。

固相合成PS2键的典型循环不同于合成正常磷酸键的标准循环。偶合后，然后用DDTT硫化所得的硫代亚磷酸三酯。硫化后进行封端。

完成自动合成后，使用含有20mM DTT的浓氨：乙醇（3：1，v：v）混合物在55℃下进行脱保护15-16小时。

项目	目录号	包	价格（$）

DA-Thiophosphoramidite	10-1700-90	100微米	175.00
	10-1700-02	0.25克	420.00

DC-Thiophosphoramidite	10-1710-90	100微米	175.00
	10-1710-02	0.25克	420.00

DG-Thiophosphoramidite	10-1720-90	100微米	175.00
	10-1720-02	0.25克	420.00

DT-Thiophosphoramidite	10-1730-90	100微米	175.00
	10-1730-02	0.25克	420.00

参考

J. Nielsen，WKD Brill和MH Caruthers，Tetrahedron Letters，1988,29,2911-2914。
L.Cummins，D.Graff，G.Beaton，WSMarshall，和MH Caruthers，Biochemistry，1996,35,8734-41。
X.Yang和DG Gorenstein，Curr Drug Targets，2004,5,705-15。
W .S。Marshall，和MH Caruthers，Science，1993,259,1564-70。
JL Tonkinson等，Antisense Research and Development，1994,4,269-278。
X.Yang等，Bioorg Med Chem Lett，1999,9,3357-62。
X.Yang等人，Ann NY Acad Sci，2006,1082,116-9。
X.Yang等，Nucleic Acids Res，2002,30，e132。

其他仪器类型

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硫化试剂

Glen Research的硫化试剂用于使用CE亚磷酰胺化学制备硫代磷酸酯键。每种试剂都具有以下属性：

可靠地溶解，使其可以安全地用于自动合成器。
反应快速（30秒），使得该过程在小规模上方便，并且易于扩大规模。
过程是有效的，优于96％的连接是硫代磷酸酯，其余是磷酸二酯。

订购硫化剂（Beaucage Reagent）时，请同时订购适合您仪器的硅烷化瓶。提供试剂订单时，一瓶不收费。

在用乙腈冲洗并干燥后，可以重复使用硅烷化瓶。额外的硅烷化瓶的价格如下所示。将试剂溶解在乙腈中，浓度为1g / 100mL。硫化试剂II（3 - （（二甲氨基亚甲基）氨基）-3H-1,2,4-二噻唑-3-硫酮，DDTT）具有Beaucage的所有性质试剂在合成器中增加溶液稳定性并提供强硫酸化RNA连接能力。硫化试剂II有粉末形式和稳定的溶液。

项目	目录号	包	价格（$）

硅烷化试剂	40-4036-10	1克	停产
	40-4036-20	2克	停产
硫化试剂已经停产。

Silanized Bottle（与硫化试剂一起订购时，一瓶免费）
ABI（240mL容量）	40-4036-A1	每	停产
ABI（240mL容量）已停产。

ABI（450mL容量）	40-4036-A2	每	停产
ABI（450mL容量）已经停产。

加速8905（150mL容量）	40-4036-C3	每	停产
加速8905（150mL容量）已经停产。

加速8909和Cyclone（240mL容量）	40-4036-C4	每	停产
加速8909和Cyclone（240mL容量）已经停产。

硫化试剂II	40-4037-10	1克	50.00
	40-4037-20	2克	100.00
以1g / 100mL的浓度溶解，形成约0.05M的溶液

在吡啶/乙腈中的0.05M硫化试剂II	40-4137-51	100毫升	100.00
	40-4137-52	200毫升	200.00

货号	品名	规格	目录价	品牌
10-0001-02	dA-5'-CE Phosphoramidite	0.25grams	1275	glen research
10-0001-05	dA-5'-CE Phosphoramidite	0.5grams	2550	glen research
10-0001-10	dA-5'-CE Phosphoramidite	1.0gram	5100	glen research
10-0101-02	dC-5'-CE Phosphoramidite	0.25grams	1275	glen research
10-0101-05	dC-5'-CE Phosphoramidite	0.5grams	2550	glen research
10-0101-10	dC-5'-CE Phosphoramidite	1.0gram	5100	glen research
10-0301-02	dT-5'-CE Phosphoramidite	0.25grams	1275	glen research
10-0301-05	dT-5'-CE Phosphoramidite	0.5grams	2550	glen research
10-0301-10	dT-5'-CE Phosphoramidite	1.0gram	5100	glen research
10-1000-02	dA-CE Phosphoramidite	0.25grams	212.5	glen research
10-1000-02M	dA-CE Phosphoramidite	0.25grams	212.5	glen research
10-1000-05	dA-CE Phosphoramidite	0.5grams	425	glen research
10-1000-05M	dA-CE Phosphoramidite	0.5grams	425	glen research
10-1000-10	dA-CE Phosphoramidite	1.0gram	850	glen research
10-1000-10M	dA-CE Phosphoramidite	1.0gram	850	glen research
10-1000-1C	dA-CE Phosphoramidite	1.0gram	850	glen research
10-1000-1S	dA-CE Phosphoramidite	10.0grams	8500	glen research
10-1000-20	dA-CE Phosphoramidite	2.0grams	1700	glen research
10-1000-2C	dA-CE Phosphoramidite	2.0grams	1700	glen research
10-1000-40	dA-CE Phosphoramidite	4.0grams	3400	glen research
10-1000-50	dA-CE Phosphoramidite	5.0grams	4250	glen research
10-1000-5S	dA-CE Phosphoramidite	5.0grams	4250	glen research
10-1000-C2	dA-CE Phosphoramidite	0.25grams	212.5	glen research
10-1000-C5	dA-CE Phosphoramidite	0.5grams	425	glen research
10-1001-02	7-Deaza-dA-CE Phosphoramidite	0.25grams	16575	glen research
10-1001-90	7-Deaza-dA-CE Phosphoramidite	100µmoles	6035	glen research
10-1001-95	7-Deaza-dA-CE Phosphoramidite	50µmoles	3017.5	glen research
10-1002-02	dA+dG-CE Phosphoramidite	0.25grams	680	glen research
10-1003-02	N6-Me-dA-CE Phosphoramidite	0.25grams	8415	glen research
10-1003-90	N6-Me-dA-CE Phosphoramidite	100µmoles	2762.5	glen research
10-1004-02	3'-dA-CE Phosphoramidite	0.25grams	16575	glen research
10-1004-90	3'-dA-CE Phosphoramidite	100µmoles	6035	glen research
10-1004-95	3'-dA-CE Phosphoramidite	50µmoles	3017.5	glen research
10-1006-02	Etheno-dA-CE Phosphoramidite	0.25grams	4335	glen research
10-1006-90	Etheno-dA-CE Phosphoramidite	100µmoles	1785	glen research
10-1007-02	8-Br-dA-CE Phosphoramidite	0.25grams	5015	glen research
10-1007-90	8-Br-dA-CE Phosphoramidite	100µmoles	1955	glen research
10-1008-02	8-oxo-dA-CE Phosphoramidite	0.25grams	6035	glen research
10-1008-90	8-oxo-dA-CE Phosphoramidite	100µmoles	2295	glen research
10-1010-02	dC-CE Phosphoramidite	0.25grams	212.5	glen research
10-1010-02M	dC-CE Phosphoramidite	0.25grams	212.5	glen research
10-1010-05	dC-CE Phosphoramidite	0.5grams	425	glen research
10-1010-05M	dC-CE Phosphoramidite	0.5grams	425	glen research
10-1010-10	dC-CE Phosphoramidite	1.0gram	850	glen research
10-1010-10M	dC-CE Phosphoramidite	1.0gram	850	glen research
10-1010-1C	dC-CE Phosphoramidite	1.0gram	850	glen research
10-1010-1S	dC-CE Phosphoramidite	10.0grams	8500	glen research
10-1010-20	dC-CE Phosphoramidite	2.0grams	1700	glen research
10-1010-2C	dC-CE Phosphoramidite	2.0grams	1700	glen research
10-1010-40	dC-CE Phosphoramidite	4.0grams	3400	glen research
10-1010-50	dC-CE Phosphoramidite	5.0grams	4250	glen research
10-1010-5S	dC-CE Phosphoramidite	5.0grams	4250	glen research
10-1010-C2	dC-CE Phosphoramidite	0.25grams	212.5	glen research
10-1010-C5	dC-CE Phosphoramidite	0.5grams	425	glen research
10-1013-02	dC+dT-CE Phosphoramidite	0.25grams	680	glen research
10-1014-02	pdC-CE Phosphoramidite	0.25grams	4165	glen research
10-1014-05	pdC-CE Phosphoramidite	0.5grams	8330	glen research
10-1014-90	pdC-CE Phosphoramidite	100µmoles	1445	glen research
10-1015-02	Ac-dC-CE Phosphoramidite	0.25grams	212.5	glen research
10-1015-02M	Ac-dC-CE Phosphoramidite	0.25grams	212.5	glen research
10-1015-05	Ac-dC-CE Phosphoramidite	0.5grams	425	glen research
10-1015-05M	Ac-dC-CE Phosphoramidite	0.5grams	425	glen research
10-1015-10	Ac-dC-CE Phosphoramidite	1.0gram	850	glen research
10-1015-10M	Ac-dC-CE Phosphoramidite	1.0gram	850	glen research
10-1015-1C	Ac-dC-CE Phosphoramidite	1.0gram	850	glen research
10-1015-1S	Ac-dC-CE Phosphoramidite	10.0grams	8500	glen research
10-1015-20	Ac-dC-CE Phosphoramidite	2.0grams	1700	glen research
10-1015-2C	Ac-dC-CE Phosphoramidite	2.0grams	1700	glen research
10-1015-40	Ac-dC-CE Phosphoramidite	4.0grams	3400	glen research
10-1015-50	Ac-dC-CE Phosphoramidite	5.0grams	4250	glen research
10-1015-5S	Ac-dC-CE Phosphoramidite	5.0grams	4250	glen research
10-1015-C2	Ac-dC-CE Phosphoramidite	0.25grams	212.5	glen research
10-1015-C5	Ac-dC-CE Phosphoramidite	0.5grams	425	glen research
10-1016-02	TMP-F-dU-CE Phosphoramidite	0.25grams	8415	glen research
10-1016-90	TMP-F-dU-CE Phosphoramidite	100µmoles	3315	glen research
10-1017-02	Pyrrolo-dC-CE Phosphoramidite	0.25grams	11475	glen research
10-1017-90	Pyrrolo-dC-CE Phosphoramidite	100µmoles	3740	glen research
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