加热和运行DNA去除试剂盒
可以预期 RNA 完整性的一些损失。因此,不建议在 qPCR 设置之外使用试剂盒。
根据 qPCR 指导原则设计引物。
确保 RNA 和反应缓冲液在混合前冰冷。
HL-dsDNase 消化含有终 Mg2+ 因此,RT 反应中镁的残留必须为
考虑。如果使用 10µl 消化的 RNA,20µl RT 反应中的镁浓度将增加 1.5 mM。
如果用于下游 cDNA 合成的 RT 试剂盒与额外的镁不相容,则可实施以下步骤:
使用较小部分经 DNase 处理的 RNA 进行逆转录
Nase 处理(多 50µl)。考虑 Mg2+ 将存在于剩余 RNA 中,这可能影响其长期稳定性。
如果 RNA 的体积超过 20µl,可能有利于将 HL-dsDNase 的量加倍。
反转录前避免将去污的 RNA 和引物预热到 60 ℃ 以上。
ArcticZymes 的 Heat&Run gDNA removal kit 预期用于从高质量 RNA 中去除 gDNA,用于 qPCR。RNA 浓度 > 50 ng/
推荐使用 µl。该试剂盒基于 ArcticZymes 公司的热不稳定双链特异性 dna 酶(HL-dsdna 酶)。DNase 处理后,HL-dsDNase 很容易被温度的适度升高 (58 ℃) 灭活。gDNA 去除和逆转录可以在同一管中进行,从而大限度地减少移液步骤,减少动手时间。
HL-dsDNase 是来自北极虾的 dsDNase 的突变版本。HL-dsDNase 在非动物宿主(酵母)中重组表达。
80200-50:HL-dsDNase(1 瓶)和 10x 反应缓冲液(2 瓶),足以进行 50 次反应。
参见标签。
储存
Store at -20 °C 下储存。建议等分反应缓冲液,以避免反复冻融循环。
保持反应缓冲液冷却。
样品材料
HL-dsDNase 适用于任何来源 RNA 的去污。该试剂盒与 RNase 抑制剂相容。EDTA 和高盐浓度会降低 HL-dsDNase 的活性。
检测试剂盒内容物是否存在 RNase。
方案
设置加热和运行反应,如下所示:
注:如果预期使用同管逆转录,确保 HL-dsDNase 反应的总体积不超过 RT-kit 的大输入限值。
注:也可在 25 ℃ 孵育 20 min。
注:将您选择的 RT 试剂直接加入 HL-dsDNase 反应混合物中。
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