TriLink提供了一个3'iCLIP底漆,用于iCLIP应用程序。紫外线交联免疫沉淀(CLIP)是一种阐明RNA与蛋白质相互作用的强大技术。标准协议通常采用标记的衔接子来可视化蛋白质-RNA复合物。该方法涉及RNA与蛋白质的不可逆交联,免疫沉淀,5'和3'衔接子的连接,逆转录,后是PCR扩增。不幸的是,逆转录酶无法读取交联区域,这会产生截短的cDNA,而没有启动PCR扩增所需的3'和5'衔接子。
CLIP方法的一种变化,单个核苷酸分辨率的UV交联和免疫沉淀(iCLIP)通过使用预腺苷酸化引物(iCLIP引物)和逆转录产物的环化来解决此问题。该方法也将结合位点解析为各个核苷酸,并提高了位于重复基序内的结合位点的准确性。
trilinkbiotech免疫沉淀产品
3' iCLIP Primer
Cat #: O-30050
SKU | Unit Size |
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O-30050-03 | 3 nmole |
O-30050-09 | 3 x 3 nmole |
PO DNA,5'(rApp)AGA TCG GAA GAG CGG TTC AG(ddC)3'UV交联和免疫沉淀(CLIP)的开发可鉴定RNA-蛋白质相互作用(Ule J等,2003)。该方法涉及RNA与蛋白质的不可逆交联,免疫沉淀,5'和3'衔接子的连接,逆转录以及后的PCR扩增。不幸的是,CLIP受到限制,因为逆转录酶无法读取交联区域。这样就创建了不需要启动PCR扩增所需的3'和5'衔接子的截短的cDNA。虽然存在多种CLIP方法版本,但单个核苷酸分辨率的UV交联和免疫沉淀(iCLIP)具有许多优势。iCLIP解决了截短cDNA扩增差的问题。这可以通过使用预腺苷酸化引物(iCLIP引物)和逆转录产物的环化来实现。该方法还解析了与单个核苷酸的结合位点,并提高了位于重复基序内的结合位点的准确性(Konig J et al。2010.,Konig J et al。2011)。
货号 | O-30050 |
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质量控制 | 通过 |
骨干 | 磷酸二酯 |
序列 | 5(rApp)AGA TCG GAA GAG CGG TTC AG(ddC)3 |
推荐储存 | -20°C以下 |
应用 | 下一代测序(NGS) |