Akoya Biosciences是Akoya Biosciences，Inc.（一家特拉华州公司）的注册商标，而Spatial Biology Company是Akoya Biosciences，Inc.的商标。
表征组织微环境的复杂性是理解驱动疾病以及治疗反应的分子和细胞机制的关键要素。
浸润的免疫细胞和细胞基质重塑之间的空间关系作用被广泛认为是定义组织异质性的关键成分。CODEX系统使研究人员能够以单细胞分辨率对组织样品中的40多种蛋白质标记物成像。高度复用的成像技术可以研究不同的细胞表型，以及它们如何在原位相互作用以影响疾病的病理和进展。
CODEX（通过indEXing进行共检测）技术使用与专有Akoya条形码偶联的抗体，该条形码由*的寡核苷酸序列组成。CODEX分析法使用染料标记的Reporter靶向特定条形码，以进行高度特异性的检测。
用CODEX抗体板对组织样品进行单步染色，然后Reporters通过成像和去除的迭代循环与互补条形码结合。循环由CODEX流体力学仪器*自动化。
灵活
为新鲜的冷冻或FFPE组织设计定制面板
样品友好
可以对样本重新成像以进行感兴趣区域（ROI）分析
可扩展
以单细胞分辨率在单个组织样本中成像40+个标记
全面
包括试剂和软件分析套件
CODEX解决方案与许多组织类型和格式兼容。
人类乳腺FFPE组织被36重面板染色
肺癌FFPE组织被28重面板染色
人体皮肤新鲜的冷冻组织沾有26层面板
固定人PBMC并用26重面板染色
肾细胞癌FFPE组织用15重面板染色
弄脏
使用CODEX抗体面板准备和染色组织只需一步即可，从而减少了周转时间并保持了样品完整性。
图片
全自动CODEX仪器和配套显微镜在您的组织中对40多个标记图像进行成像。用户可以将目标分辨率降至20倍的单细胞分辨率，将目标分辨率降至40倍的亚细胞分辨率。
分析
使用全面的CODEX软件套件处理，分析和可视化图像。用户可以访问可视化工具，如用于细胞表型的门控和聚类。用户还可以导出文件以在第三方软件中使用。
医学博士安德拉斯·阿·赫兹（Andras A Heczey）
丹·L·邓肯综合癌症中心儿科肿瘤学助理教授
贝勒医学院
输液后活检非常珍贵……借助CODEX，我们的目标是从组织的小样本中获取多的数据，以尽可能多地了解肿瘤的微环境。
Garry Nolan博士
Rachford和Carlota A. Harris微生物学和免疫学系教授
斯坦福大学，Akoya Biosciences联合创始人
CODEX的商业发布是我实验室的一个里程碑，也是生物医学科学的一个令人兴奋的机会。同时经济地分析完整组织上数十种或更多种蛋白质标记的能力将从根本上改变我们对细胞相互作用和疾病生物学的理解。
范德比尔特糖尿病中心的Powers＆Brissova研究小组使用CODEX来研究胰岛微环境。
斯坦福大学的细胞科学成像设施（CSIF）通过CODEX系统上的多重成像项目扩展了其核心实验室服务。
宾夕法尼亚大学的研究人员开发了一种方法，可以将单细胞CITE-seq数据映射到CODEX复用IHC图像，以进行空间单细胞多组学研究。
CODEX分析法通过迭代成像循环靶向抗体组的子集，从而克服了传统的多重免疫荧光技术的挑战，从而在单个组织切片中揭示了40多种生物标志物。
我们提供了完整的解决方案，其中包括针对CODEX系统进行了优化和验证的抗体和试剂。经验证和库存的抗体可用于不同类型的组织：小鼠新鲜冷冻，人新鲜冷冻和人FFPE。用户可以使用Akoya的定制偶联试剂盒灵活地创建由市售的，经Akoya验证的抗体或标有CODEX条形码的克隆组成的面板。
试剂盒和试剂
用于组织染色，自定义缀合和执行CODEX实验的缓冲液和试剂
CODEX抗体
CODEX共轭抗体，用于构建抗体面板
CODEX条码
修饰寡核苷酸，易于偶联定制CODEX抗体
CODEX记者
荧光团偶联的寡核苷酸，用于CODEX抗体的可视化
试剂盒和试剂
CODEX分析需要专门配制的试剂和缓冲液，以使用CODEX抗体对组织染色并进行迭代成像循环。对于每个成像周期，将三个带有特定光谱染料的CODEX Reporter应用于染色的组织，以可视化相应的CODEX抗体。该CODEX仪器适用轻柔洗涤步骤去除CODEX记者无任何化学修饰，随后施加下一组记者的想象下一组CODEX抗体。
目录 ＃ | 名称 | 尺寸 |
| 7000001 | 10X CODEX缓冲区 | 10个反应 |
| 7000002 | CODEX检测试剂 | 10个反应 |
| 7000003 | 核染色 | 10个反应 |
| 7000008 | CODEX染色套件 | 10个反应 |
| 7000009 | CODEX偶联试剂盒 | 10个反应 |
| 7000010 | CODEX垫片v2 | 10个垫片 |
| 232107 | CODEX存储缓冲区 | 120毫升 |
| 7000005 | 盖玻片 | 138 |
| 7000006 | 96孔板 | 10 |
| 7000007 | 96孔板密封 | 10 |
| 7000013 | CODEX盖玻片储物盒 | 1盒 |
CODEX抗体
CODEX抗体是单独提供的，可以混合使用并与设计面板匹配，以同时分析多达40多种生物标志物。
Akoya提供经过充分测试的CODEX抗体和一系列补充抗体。
CODEX ®盘点抗体
CODEX清单抗体由Akoya提供，并已通过完整的CODEX抗体验证过程和制造质量控制。我们库存的抗体也得到了我们现场支持团队的全面支持。
CODEX抗体已在多种类型的人类FFPE组织中进行了测试。这些CODEX抗体与不同的CODEX条形码（BX000）结合。每个试剂盒包含一管CODEX抗体和一管相应的染料标记的Reporter（RX000），在标准染色条件下有足够的容量用于25 CODEX运行（或测试）。推荐用于FFPE组织的染料是Atto 550，Cy5和Alexa Fluor™750。
目录 ＃ | 名称 | 尺寸 |
| 4450036 | b-Catenin1-BX020（12F7）-Atto 550-RX020 | 25项测试 |
| 4450030 | CD3e-BX045（EP449E）—Cy5-RX045 | 25项测试 |
| 4350018 | CD4-BX003（EPR6855）—Cy5-RX003 | 25项测试 |
| 4250012 | CD8-BX026（C8 / 144B）-Atto 550-RX026 | 25项测试 |
| 4350020 | CD11c-BX024（118 / A5）—Cy5-RX024 | 25项测试 |
| 4150018 | CD20-BX007（L26）— Alexa Fluor™488-RX007 | 25项测试 |
| 4450018 | CD20-BX007（L26）— Alexa Fluor™750-RX007 | 25项测试 |
| 4450027 | CD21-BX032（EP3093）—阿托550-RX032 | 25项测试 |
| 4150017 | CD31-BX001（EP3095）— Alexa Fluor™488-RX001 | 25项测试 |
| 4450017 | CD31-BX001（EP3095）— Alexa Fluor™750-RX001 | 25项测试 |
| 4250002 | CD44-BX005（IM7）-阿托550-RX005 | 25项测试 |
| 4250023 | CD45RO-BX017（UCHL1）-Atto 550-RX017 | 25项测试 |
| 4350019 | CD68-BX015（KP1）—Cy5-RX015 | 25项测试 |
| 4350001 | CD107a-BX006（H4A3）—Cy5-RX006 | 25项测试 |
| 4250021 | E-cadherin-BX014（4A2C7）-Atto 550-RX014 | 25项测试 |
| 4350021 | 组蛋白H3磷酸酯（Ser28）-BX030（HTA28）-Cy5-RX030 | 25项测试 |
| 4450029 | HLA-DR-BX033（EPR3692）—Cy5-RX033 | 25项测试 |
| 4450031 | 角蛋白14-BX002（聚19053）—阿托550-RX002 | 25项测试 |
| 4250019 | Ki67-BX047（B56）-Atto 550-RX047 | 25项测试 |
| 4450032 | LIF-BX006（M1506B09）—Cy5-RX006 | 25项测试 |
| 4450034 | Mac2 / Galectin-3-BX035（M3 / 38）-Atto 550-RX035 | 25项测试 |
| 4150020 | 泛细胞角蛋白BX019（AE-1 / AE-3）-Alexa Fluor™488-RX019 | 25项测试 |
| 4450020 | 泛细胞角蛋白BX019（AE-1 / AE-3）-Alexa Fluor™750-RX019 | 25项测试 |
| 4250004 | Podoplanin-BX023（NC-08）-Atto 550-RX023 | 25项测试 |
| 4450033 | TFAM-BX029（18G102B2E11）-Atto 550-RX029 | 25项测试 |
已经使用扁桃体组织测试了用于人类新鲜冷冻组织的CODEX抗体。这些CODEX抗体与不同的CODEX条形码（BX000）结合。每个试剂盒包含一管CODEX抗体和一管相应的染料标记的Reporter（RX000），在标准染色条件下有足够的容量用于25 CODEX运行（或测试）。推荐用于人类新鲜冷冻组织的染料是Atto 550，Cy5和Alexa Fluor™488。
目录＃ | 名称 | 尺寸 |
| 4250005 | CD2-BX002（RPA-2.10）-Atto 550-RX002 | 25项测试 |
| 4350008 | CD3-BX015（UCHT1）—Cy5-RX015 | 25项测试 |
| 4350010 | CD4-BX021（SK3）—Cy5-RX021 | 25项测试 |
| 4150004 | CD8-BX004（SK1）—Alexa Fluor™488-RX004 | 25项测试 |
| 4450004 | CD8-BX004（SK1）— Alexa Fluor™750-RX004 | 25项测试 |
| 4350012 | CD11c-BX027（S-HCL-3）—Cy5-RX027 | 25项测试 |
| 4350003 | CD19-BX003（HIB19）—Cy5-RX003 | 25项测试 |
| 4150009 | CD21-BX013（Bu32）-Alexa Fluor™488-RX013 | 25项测试 |
| 4450009 | CD21-BX013（Bu32）-Alexa Fluor™750-RX013 | 25项测试 |
| 4250009 | CD31-BX032（WM59）—阿托550-RX032 | 25项测试 |
| 4250020 | CD34-BX035（561）-阿托550-RX035 | 25项测试 |
| 4150007 | CD38-BX007（HB-7）-Alexa Fluor™488-RX007 | 25项测试 |
| 4450007 | CD38-BX007（HB-7）-Alexa Fluor™750-RX007 | 25项测试 |
| 4150003 | CD45-BX001（HI30）— Alexa Fluor™488-RX001 | 25项测试 |
| 4450003 | CD45-BX001（HI30）— Alexa Fluor™750-RX001 | 25项测试 |
| 4250023 | CD45RO-BX017（UCHL1）-Atto 550-RX017 | 25项测试 |
| 4350007 | CD49f-BX033（GoH3）—Cy5-RX033 | 25项测试 |
| 4250022 | CD69-BX041（FN50）-阿托550-RX041 | 25项测试 |
| 4150021 | CD90-BX022（5E10）－Alexa Fluor™488-RX022 | 25项测试 |
| 4450021 | CD90-BX022（5E10）－Alexa Fluor™750-RX022 | 25项测试 |
| 4250008 | CD104-BX005（58XB4）-Atto 550-RX005 | 25项测试 |
| 4150008 | CD138-BX010（MI15）-Alexa Fluor™488-RX010 | 25项测试 |
| 4450008 | CD138-BX010（MI15）— Alexa Fluor™750-RX010 | 25项测试 |
| 4250013 | CD278-BX017（C398.4A）-Atto 550-RX017 | 25项测试 |
| 4250010 | CD279-BX014（EH12.2H7）-Atto 550-RX014 | 25项测试 |
| 4250006 | HLA-DR-BX026（L243）—阿托550-RX026 | 25项测试 |
| 4250019 | Ki67-BX047（B56）-Atto 550-RX047 | 25项测试 |
| 4150020 | 泛细胞角蛋白BX019（AE-1 / AE-3）-Alexa Fluor™488-RX019 | 25项测试 |
| 4450020 | 泛细胞角蛋白BX019（AE-1 / AE-3）-Alexa Fluor™750-RX019 | 25项测试 |
| 4250004 | Podoplanin-BX023（NC-08）-Atto 550-RX023 | 25项测试 |
已使用脾脏组织测试了用于小鼠新鲜冷冻组织的CODEX抗体。这些CODEX抗体与不同的CODEX条形码（BX000）结合。每个试剂盒包含一管CODEX抗体和一管相应的染料标记的Reporter（RX000），在标准染色条件下有足够的容量用于25 CODEX运行（或测试）。推荐用于小鼠新鲜冷冻组织的染料是Atto 550，Cy5和Alexa Fluor™488。
目录＃ | 名称 | 尺寸 |
| 4350014 | CD3-BX021（17A2）—Cy5-RX021 | 25项测试 |
| 4250016 | CD4-BX026（RM4-5）—阿托550-RX026 | 25项测试 |
| 4250007 | CD5-BX017（53-7.3）-Atto 550-RX017 | 25项测试 |
| 4250017 | CD8a-BX029（53-6.7）-Atto 550-RX029 | 25项测试 |
| 4150015 | CD11b-BX025（M1 / 70）—Alexa Fluor™488-RX025 | 25项测试 |
| 4450015 | CD11b-BX025（M1 / 70）-Alexa Fluor™750-RX025 | 25项测试 |
| 4350013 | CD11c-BX030（N418）—Cy5-RX030 | 25项测试 |
| 4250014 | CD19-BX020（6D5）-Atto 550-RX020 | 25项测试 |
| 4250015 | CD21 / 35-BX023（7E9）-Atto 550-RX023 | 25项测试 |
| 4150014 | CD24-BX022（M1 / 69）—Alexa Fluor™488-RX022 | 25项测试 |
| 4450014 | CD24-BX022（M1 / 69）－Alexa Fluor™750-RX022 | 25项测试 |
| 4250001 | CD31-BX002（MEC13.3）-Atto 550-RX002 | 25项测试 |
| 4150013 | CD38-BX019（90）— Alexa Fluor™488-RX019 | 25项测试 |
| 4450013 | CD38-BX019（90）－Alexa Fluor™750-RX019 | 25项测试 |
| 4250002 | CD44-BX005（IM7）-阿托550-RX005 | 25项测试 |
| 4150002 | CD45-BX007（30-F11）— Alexa Fluor™488-RX007 | 25项测试 |
| 4450002 | CD45-BX007（30-F11）— Alexa Fluor™750-RX007 | 25项测试 |
| 4150006 | CD45R / B220-BX010（Ra3-6B2）-Alexa Fluor™488-RX010 | 25项测试 |
| 4450006 | CD45R / B220-BX010（Ra3-6B2）-Alexa Fluor™750-RX010 | 25项测试 |
| 4350007 | CD49f-BX033（GoH3）—Cy5-RX033 | 25项测试 |
| 4350016 | CD71-BX027（RI7217）—Cy5-RX027 | 25项测试 |
| 4450001 | CD90.2-BX001（30-H12）－Alexa Fluor™750-RX001 | 25项测试 |
| 4150001 | CD90.2-BX001（30-H12）－Alexa Fluor™488-RX001 | 25项测试 |
| 4350005 | CD169-BX015（3D6.112）—Cy5-RX015 | 25项测试 |
| 4150012 | IgD-BX016（11-26c.2a）-Alexa Fluor™488-RX016 | 25项测试 |
| 4450012 | IgD-BX016（11-26c.2a）-Alexa Fluor™750-RX016 | 25项测试 |
| 4150011 | IgM-BX013（RMM-1）-Alexa Fluor™488-RX013 | 25项测试 |
| 4450011 | IgM-BX013（RMM-1）-Alexa Fluor™750-RX013 | 25项测试 |
| 4250019 | Ki67-BX047（B56）-Atto 550-RX047 | 25项测试 |
| 4350015 | Ly6g-BX024（1A8）—Cy5-RX024 | 25项测试 |
| 4250003 | MHC II-BX014（M5 / 114.15.2）-Atto 550-RX014 | 25项测试 |
| 4350006 | TCRb-BX003（H57-597）—Cy5-RX003 | 25项测试 |
| 4150005 | Ter119-BX004（TER-119）-Alexa Fluor™488-RX004 | 25项测试 |
| 4450005 | Ter119-BX004（TER-119）-Alexa Fluor™750-RX004 | 25项测试 |
CODEX ®屏蔽抗体
Akoya并未列出或提供CODEX筛选的抗体，但包括一系列已纯化并成功与CODEX Barcodes结合并在次级淋巴组织中显示阳性染色信号的克隆。这些克隆可从其他抗体供应商处商购获得，但需要终用户偶联。CODEX条形码和相关的共轭协议可通过Akoya获得。
CODEX ®社区抗体
CODEX用户群在不断增长，我们鼓励跨客户站点的协作，以共享他们经过CODEX测试的克隆和协议的列表。这些CODEX社区抗体虽然证明与CODEX仪器兼容，但不会通过Akoya出售。终用户需要共轭。CODEX条形码和相关的共轭协议可通过Akoya获得。我们正在继续扩大名单。
CODEX ®抗体的自定义面板设计
Akoya的CODEX系统为用户提供了灵活性，可以使用自定义偶联试剂盒创建由Akoya验证的抗体或标有CODEX Barcodes的克隆组成的面板。用户可以使用CODEX偶联试剂盒和各个CODEX条形码从第三方抗体供应商处稳健地制备克隆。
CODEX条码
CODEX条形码与CODEX偶联试剂盒一起使用，可用于定制抗体面板设计。每个试剂盒均包含一管冻干条形码，用于单个结合反应；两管Reporters，用于优化CODEX抗体滴定和CODEX运行。对于每个条形码，都有足够的体积用于50 µg抗体偶联，根据产量和滴度，可以提供足够的材料用于10至50个染色。
